Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3P2A6NIE6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms