Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APPL1Q9UKG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APPL1Q9UKG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms