Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCN11AQ9UI33 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms