Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX15Q9NRS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX15Q9NRS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms