Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SARS2Q9NP81 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SARS2Q9NP81 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms