Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms