Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms