Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VPS25Q9BRG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPS25Q9BRG1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms