Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRC1Q96M27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms