Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABS1Q96KC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms