Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC136Q96JN2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC136Q96JN2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms