Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSANTD3Q96H12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD3Q96H12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms