Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATRIPQ8WXE1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms