Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00301Q8NCQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms