Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETMD1Q6P1Q0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms