Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX2Q3B8N5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX2Q3B8N5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms