Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC1Q15915 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC1Q15915 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms