Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NEDD8Q15843 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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