Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIGQ13278 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIGQ13278 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIGQ13278 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIGQ13278 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIGQ13278 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIGQ13278 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIGQ13278 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIGQ13278 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIGQ13278 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIGQ13278 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIGQ13278 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIGQ13278 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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