Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	CKA2	YOR061W	1020 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	DNF2	YDR093W	4839 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.73	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	MLF3	YNL074C	1359 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	GRX4	YER174C	735 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	SPL2	YHR136C	447 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	CTR2	YHR175W	570 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	YJL107C	YJL107C	1164 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	SPG4	YMR107W	348 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	UBA2	YDR390C	1911 nt		5.72	□□□□□ -1.49
MRD1	Q06106	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		5.71	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	PDR10	YOR328W	4695 nt		5.71	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	PDI1	YCL043C	1569 nt		5.71	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.71	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	PMT2	YAL023C	2280 nt		5.71	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	RML2	YEL050C	1182 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	XPT1	YJR133W	630 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	MDY2	YOL111C	639 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	ISU2	YOR226C	471 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	HXT4	YHR092C	1731 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	NGR1	YBR212W	2019 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	ZUO1	YGR285C	1302 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	SIP5	YMR140W	1470 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	PUS1	YPL212C	1635 nt		5.7	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YNG2	YHR090C	849 nt		5.69	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YJR085C	YJR085C	318 nt		5.69	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	PEX32	YBR168W	1242 nt		5.69	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	FUI1	YBL042C	1920 nt		5.69	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	DAK1	YML070W	1755 nt		5.69	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YEF1	YEL041W	1488 nt		5.69	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	SSY5	YJL156C	2100 nt		5.68	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	KRE9	YJL174W	831 nt		5.68	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	CTS1	YLR286C	1689 nt		5.68	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	HES1	YOR237W	1305 nt		5.68	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	MIM2	YLR099W-A	264 nt		5.67	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		5.67	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	CUE5	YOR042W	1236 nt		5.67	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	SYG1	YIL047C	2709 nt		5.66	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	MED4	YOR174W	855 nt		5.66	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	MRI1	YPR118W	1236 nt		5.66	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	HOS2	YGL194C	1359 nt		5.66	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YGR291C	YGR291C	222 nt		5.65	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	RSA3	YLR221C	663 nt		5.65	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YMR147W	YMR147W	672 nt		5.65	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	CWC25	YNL245C	540 nt		5.65	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.65	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		5.65	□□□□□ -1.5
MRD1	Q06106	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.65	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	ADE3	YGR204W	2841 nt		5.64	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.64	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	SFT2	YBL102W	648 nt		5.64	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	MGR2	YPL098C	342 nt		5.64	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YAP1802	YGR241C	1707 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	ARB1	YER036C	1833 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	THI5	YFL058W	1023 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	THI12	YNL332W	1023 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	TRM10	YOL093W	882 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	SCP1	YOR367W	603 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	UGA2	YBR006W	1494 nt		5.63	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YIL092W	YIL092W	1902 nt		5.62	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	GAT3	YLR013W	426 nt		5.62	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	ARG8	YOL140W	1272 nt		5.62	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	RPN5	YDL147W	1338 nt		5.62	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.62	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	UPS3	YDR185C	540 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	DIT1	YDR403W	1611 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	PAD1	YDR538W	729 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	NOP16	YER002W	696 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	SPC97	YHR172W	2472 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	URA7	YBL039C	1740 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	AST1	YBL069W	1290 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	PHA2	YNL316C	1005 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	MCH4	YOL119C	1506 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YOR342C	YOR342C	960 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YPL199C	YPL199C	723 nt		5.61	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	TUP1	YCR084C	2142 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	SRV2	YNL138W	1581 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	APM1	YPL259C	1428 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YLH47	YPR125W	1365 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	PEX19	YDL065C	1029 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	URA3	YEL021W	804 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	RRT7	YLL030C	342 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	MRPL39	YML009C	213 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	PRE2	YPR103W	864 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	ARN2	YHL047C	1863 nt		5.6	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	LAS21	YJL062W	2493 nt		5.59	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.59	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	CTR3	YLR411W	726 nt		5.59	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	YNL174W	YNL174W	573 nt		5.59	□□□□□ -1.51
MRD1	Q06106	DOA1	YKL213C	2148 nt		5.59	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.3 ms