Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARDQ03181 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARDQ03181 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms