Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBA1Q02410 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.7 ms