Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOAP61586 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOAP61586 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOAP61586 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOAP61586 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOAP61586 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOAP61586 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOAP61586 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOAP61586 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOAP61586 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOAP61586 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOAP61586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOAP61586 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOAP61586 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOAP61586 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RHOAP61586 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOAP61586 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOAP61586 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOAP61586 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOAP61586 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOAP61586 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOAP61586 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms