Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A1P54219 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC18A1P54219 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms