Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB1P53618 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB1P53618 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB1P53618 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB1P53618 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB1P53618 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB1P53618 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB1P53618 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPB1P53618 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB1P53618 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB1P53618 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB1P53618 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPB1P53618 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB1P53618 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPB1P53618 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPB1P53618 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COPB1P53618 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPB1P53618 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPB1P53618 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPB1P53618 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPB1P53618 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPB1P53618 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPB1P53618 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms