Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD8P48556 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD8P48556 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms