Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCLCP48506 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCLCP48506 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCLCP48506 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCLCP48506 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCLCP48506 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCLCP48506 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCLCP48506 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCLCP48506 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLCP48506 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLCP48506 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLCP48506 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLCP48506 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLCP48506 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCLCP48506 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCLCP48506 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLCP48506 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLCP48506 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLCP48506 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLCP48506 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCLCP48506 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GCLCP48506 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCLCP48506 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCLCP48506 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCLCP48506 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLCP48506 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLCP48506 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLCP48506 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLCP48506 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLCP48506 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLCP48506 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms