Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSOP43234 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSOP43234 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSOP43234 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSOP43234 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSOP43234 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSOP43234 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSOP43234 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSOP43234 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSOP43234 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSOP43234 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSOP43234 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSOP43234 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSOP43234 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSOP43234 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSOP43234 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSOP43234 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSOP43234 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSOP43234 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSOP43234 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSOP43234 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSOP43234 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSOP43234 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSOP43234 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSOP43234 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSOP43234 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSOP43234 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSOP43234 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSOP43234 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms