Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 UPS3YDR185C 540 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 COS9YKL219W 1224 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 TFS1YLR178C 660 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 MID2YLR332W 1131 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 FUI1YBL042C 1920 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 SRV2YNL138W 1581 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 RSC30YHR056C 2652 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YGR266WYGR266W 2106 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YEL067CYEL067C 588 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 RMR1YGL250W 726 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YGR016WYGR016W 573 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 TRX2YGR209C 315 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 EGD2YHR193C 525 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YMR245WYMR245W 621 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YPL102CYPL102C 303 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YPL113CYPL113C 1191 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 GIP1YBR045C 1920 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 AVT3YKL146W 2079 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 EMP46YLR080W 1335 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 DOA1YKL213C 2148 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YEF1YEL041W 1488 nt4.69□□□□□ -1.66
DDI1P40087 IWR1YDL115C 1062 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 RPT6YGL048C 1218 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 ERP5YHR110W 639 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 KTI12YKL110C 942 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 MIM2YLR099W-A 264 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YNL228WYNL228W 777 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.68□□□□□ -1.66
DDI1P40087 GCN20YFR009W 2259 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 GAL10YBR019C 2100 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 TRS23YDR246W 660 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 ADD37YMR184W 597 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 COG5YNL051W 1212 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 CBC2YPL178W 627 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 ARR3YPR201W 1215 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 PRT1YOR361C 2292 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 FUM1YPL262W 1467 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YJR124CYJR124C 1347 nt4.67□□□□□ -1.66
DDI1P40087 COQ6YGR255C 1440 nt4.66□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YHL049CYHL049C 816 nt4.66□□□□□ -1.66
DDI1P40087 LST8YNL006W 912 nt4.66□□□□□ -1.66
DDI1P40087 snR19snR19 568 nt4.66□□□□□ -1.66
DDI1P40087 THP1YOL072W 1368 nt4.65□□□□□ -1.66
DDI1P40087 BUD22YMR014W 1560 nt4.65□□□□□ -1.66
DDI1P40087 NDC1YML031W 1968 nt4.65□□□□□ -1.66
DDI1P40087 ESF1YDR365C 1887 nt4.65□□□□□ -1.66
DDI1P40087 YDL172CYDL172C 480 nt4.65□□□□□ -1.67
DDI1P40087 YDR417CYDR417C 372 nt4.65□□□□□ -1.67
DDI1P40087 PCT1YGR202C 1275 nt4.65□□□□□ -1.67
DDI1P40087 NIT2YJL126W 924 nt4.65□□□□□ -1.67
DDI1P40087 KRE6YPR159W 2163 nt4.65□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MEC3YLR288C 1425 nt4.64□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MNT2YGL257C 1677 nt4.64□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ADE4YMR300C 1533 nt4.64□□□□□ -1.67
DDI1P40087 SYF2YGR129W 648 nt4.64□□□□□ -1.67
DDI1P40087 DNF2YDR093W 4839 nt4.64□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MSE1YOL033W 1611 nt4.64□□□□□ -1.67
DDI1P40087 VID30YGL227W 2877 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 STP4YDL048C 1473 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ADE3YGR204W 2841 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 CDC10YCR002C 969 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 YHR140WYHR140W 720 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MTF1YMR228W 1026 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 TLG2YOL018C 1194 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 RPL3YOR063W 1164 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 GCR2YNL199C 1605 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 THI20YOL055C 1656 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 YTA12YMR089C 2478 nt4.63□□□□□ -1.67
DDI1P40087 GIR2YDR152W 798 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 FUN19YAL034C 1242 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 CPR6YLR216C 1116 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 SNN1YNL086W 309 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MAP2YBL091C 1266 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 SFT2YBL102W 648 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ZPS1YOL154W 750 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 KTR3YBR205W 1215 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 KAP114YGL241W 3015 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MTF2YDL044C 1323 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 PRP40YKL012W 1752 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 PDR10YOR328W 4695 nt4.62□□□□□ -1.67
DDI1P40087 YEL045CYEL045C 426 nt4.61□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MNN11YJL183W 1269 nt4.61□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MED4YOR174W 855 nt4.61□□□□□ -1.67
DDI1P40087 VHS2YIL135C 1311 nt4.61□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ASA1YPR085C 1332 nt4.61□□□□□ -1.67
DDI1P40087 PRP28YDR243C 1767 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 STR2YJR130C 1920 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 STE12YHR084W 2067 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 TFB3YDR460W 966 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ELC1YPL046C 300 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MRL1YPR079W 1146 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ATG1YGL180W 2694 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 ICE2YIL090W 1476 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 IMD3YLR432W 1572 nt4.6□□□□□ -1.67
DDI1P40087 LCB2YDR062W 1686 nt4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 91.4 ms