Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN4P29074 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN4P29074 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms