Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB5P28074 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB5P28074 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms