Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN8P19075 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms