Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB1P16220 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB1P16220 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB1P16220 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB1P16220 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB1P16220 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB1P16220 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB1P16220 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB1P16220 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB1P16220 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB1P16220 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB1P16220 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB1P16220 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB1P16220 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CREB1P16220 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms