Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms