Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms