Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF40AO75400 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF40AO75400 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms