Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM4AO75164 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM4AO75164 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms