Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASA4O43374 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASA4O43374 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASA4O43374 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASA4O43374 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASA4O43374 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASA4O43374 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASA4O43374 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASA4O43374 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASA4O43374 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASA4O43374 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASA4O43374 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASA4O43374 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASA4O43374 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RASA4O43374 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RASA4O43374 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASA4O43374 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASA4O43374 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASA4O43374 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASA4O43374 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASA4O43374 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASA4O43374 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASA4O43374 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASA4O43374 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASA4O43374 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASA4O43374 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms