Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP290O15078 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP290O15078 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP290O15078 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP290O15078 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP290O15078 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP290O15078 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP290O15078 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP290O15078 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP290O15078 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP290O15078 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP290O15078 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP290O15078 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP290O15078 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP290O15078 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP290O15078 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP290O15078 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP290O15078 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP290O15078 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP290O15078 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP290O15078 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP290O15078 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP290O15078 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP290O15078 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP290O15078 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP290O15078 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP290O15078 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP290O15078 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP290O15078 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP290O15078 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP290O15078 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP290O15078 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP290O15078 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP290O15078 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP290O15078 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP290O15078 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP290O15078 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP290O15078 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP290O15078 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP290O15078 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP290O15078 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP290O15078 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP290O15078 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP290O15078 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP290O15078 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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