Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HES2Q9Y543 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HES2Q9Y543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms