Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5BQ9UGL1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms