Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA2D2Q9NY47 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D2Q9NY47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms