Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NECAP2Q9NVZ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms