Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC40A1Q9NP59 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms