Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK3Q9C098 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms