Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R3Q9BXE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R3Q9BXE9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms