Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS2Q96L46 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms