Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRPF38AQ8NAV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF38AQ8NAV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38AQ8NAV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms