Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms