Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP49Q70CQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP49Q70CQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP49Q70CQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP49Q70CQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP49Q70CQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP49Q70CQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP49Q70CQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP49Q70CQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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